Героя игры зовут Скетч Тёрнер, он художник, рисует комиксы. Однажды ночью, в сильную грозу Тёрнер трудился над своим новым творением под названием Comix Zone и неожиданно молния попала прямиком в ещё незаконченное произведение. Этот удар молнии помог выбраться на свободу главному злодею комикса - Мортусу. Оказавшись в реальном мире он бросает Скетча в его же комикс. Но так как Мортус является нарисованным персонажем, он не может полностью воплотиться в мире людей, пока жив Скетч. Теперь художнику Тёрнеру придётся пройти написанное им же произведение от начала до конца, встречая на своём пути множество нарисованных мутантов и в итоге сразиться с самим Мортусом, чтобы выбраться из комикса и навсегда обрести свободу!
