События Ecco Jr разворачиваются в то время, когда дельфин Экко был ещё совсем молодым. на этот раз Экко вместе с друзьями касаткой Тара и дельфином Китни решают отыскать большого синего кита. Вы сможете играть за любого из трёх персонажей, меняя их по ходу игры. По мере прохождения уровней, вам предстоит оказывать помощь морским жителям, а также резвиться и играть с друзьями. Управление в Ecco Junior такое же как и в предыдущих сериях игры, а вот уровень сложности резко понизил планку. Связано это с тем, что данный продукт ориентирован на более молодых геймеров. Сложность при желании можно увеличить в меню, чтобы получить для прохождения больше уровней. Из геймплея были убраны датчики жизней и воздуха, что опять же облегчает игровой процесс.
